Osadnictwo na terenie KOPALIN udokumentowane jest co najmniej 400 lat p.n.e., świadczą o nim drobne zabytki ceramiki odkryte na terenie tej miejscowości.
Nazwa oficjalnie pojawia się w inwentarzu Michała Aleksandra Lubomirskiego w 1654 roku. W pierwszej połowie XIX wieku w Kopalinach istniało Towarzystwo Szkoły Ludowej, posiadające bibliotekę z 189 książkami. Wypożyczalnia miała 47 czytelników a wypożyczeń zanotowano aż 1393. Biblioteka zlokalizowana była w szkole podstawowej istniejącej wówczas w Kopalinach.
W okresie międzywojennym na terenie wsi istniało koło młodzieży „Znicz”, na czele którego stał Michał Sroka.
Po wybuchu wojny, pod koniec grudnia w Kopalinach zostali rozstrzelani leśniczy Zbigniew Krzyszkowski wraz z Janem Wesołowskim z Woli Zabierzowskiej i Marią Dziurą z Wolicy koło Niepołomic. Przez długi okres czasu w dworze Macudzińskich w Kopalinach mieścił się Państwowy Ośrodek Maszynowy, obecnie dwór jest gruntowanie odremontowany.
Kopaliny są jedną z najmniejszych wsi Gminy Nowy Wiśnicz.
